Przedszkole Mali Odkrywcy działa w oparciu o dwa programy: "Dziecko w swoim żywiole" wydawnictwa Nowa Era oraz program "Nasze Przedszkole" przygotowany przez wydawnictwo MAC, wyróniony w konkursie Ministerstwa Edukacji Narodowej na najlepszy program wychowania przedszkolnego. Realizowane programy umożliwiają integrację z elementami wielu programów autorskich m.in.:
- - Metody Eksperymentów i Doświadczeń
- - Glottodydaktyki Bronisława Rocławskiego,
- - Dziecięcej matematyki Edyty Gruszczyk-Kolczyńskiej,
- - Zabawy literami Ireny Majchrzak,
- - Metody dobrego startu prof. Marta Bogdanowicz